EET aplikace s nejjednodušším ovládáním - bez jakéhokoli nastavení lze ihned vytvořit účtenku, která se odešle na testovací server EET.
Pro reálný provoz si musíte obstarat tzv. certifikát. Nejprve ale musíte mít přístup na stránky správce daně. Ten získáte např. návštěvou finančního úřadu, kde obdržíte obálku s přístupovým jménem a heslem. Po vyplnění několika údajů se certifikát vytvoří. Certifikát je soubor s koncovkou p12. Tento soubor zkopírujete do vašeho mobilního zařízení a v nastavení aplikace ho vyberete. Dále musíte do aplikace zadat heslo k certifikátu, které jste uvedli při jeho vytvoření, případně i číslo provozovny.